Modelos metabólicos em escala genômica fornecem um recurso valioso para estudar o metabolismo e a fisiologia celular. Esses modelos são empregados com abordagens da estrutura de modelagem baseada em restrições para prever fenótipos metabólicos e fisiológicos. O desempenho de previsão de modelos metabólicos em escala genômica pode ser melhorado incluindo restrições proteicas. Os modelos resultantes com restrição de proteínas consideram dados sobre números de rotatividade (k cat ) e facilitam a integração de abundâncias de proteínas. Nesta revisão sistemática, apresentamos e discutimos o estado da arte atual em relação à estimativa de parâmetros cinéticos utilizados em modelos com restrição de proteínas. Também destacamos como abordagens baseadas em dados e restrições podem auxiliar na estimativa dos números de rotatividade e seu uso na melhoria das previsões de fenótipos celulares. Finalmente, identificamos desafios permanentes em modelos metabólicos com restrição de proteínas e fornecemos uma perspectiva sobre abordagens futuras para melhorar o desempenho preditivo.